Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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COL4A6Q14031 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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COL4A6Q14031 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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COL4A6Q14031 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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COL4A6Q14031 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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COL4A6Q14031 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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