Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CAPSQ13938 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms