Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GTF2H2Q13888 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GTF2H2Q13888 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GTF2H2Q13888 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF2H2Q13888 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF2H2Q13888 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF2H2Q13888 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF2H2Q13888 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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GTF2H2Q13888 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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GTF2H2Q13888 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2H2Q13888 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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