Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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