Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR4Q13639 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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