Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CDH18Q13634 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CDH18Q13634 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CDH18Q13634 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDH18Q13634 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CDH18Q13634 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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CDH18Q13634 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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