Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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