Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SNTB2Q13425 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms