Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CHAF1AQ13111 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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