Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CGNL1Q0VF96 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms