Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms