Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYP4F3Q08477 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms