Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIN1Q05586 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms