Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OTUD4Q01804 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms