Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MC1RQ01726 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MC1RQ01726 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms