Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms