Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD3P84022 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD3P84022 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms