Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMF1P82094 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMF1P82094 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMF1P82094 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms