Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms