Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP107P57740 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP107P57740 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms