Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BACE1P56817 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BACE1P56817 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms