Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NME5P56597 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NME5P56597 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms