Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLE2P56282 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLE2P56282 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLE2P56282 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms