Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA4P51532 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms