Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms