Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GRIA4P48058 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms