Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA4P43681 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA4P43681 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms