Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA3P42263 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms