Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR1BP42025 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms