Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR1AP35321 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms