Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CCKARP32238 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CCKARP32238 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CCKARP32238 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCKARP32238 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCKARP32238 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CCKARP32238 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms