Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP1P29466 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP1P29466 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP1P29466 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP1P29466 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP1P29466 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP1P29466 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP1P29466 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms