Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DUSP1P28562 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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