Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms