Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT1P26358 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms