Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKCHP24723 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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