Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms