Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP4AP20648 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP4AP20648 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms