Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XBP1P17861 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XBP1P17861 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
XBP1P17861 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XBP1P17861 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
XBP1P17861 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
XBP1P17861 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XBP1P17861 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
XBP1P17861 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms