Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms