Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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