Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAV1P15498 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAV1P15498 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAV1P15498 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAV1P15498 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAV1P15498 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAV1P15498 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAV1P15498 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAV1P15498 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAV1P15498 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms