Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL6A2P12110 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms