Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT3P12035 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT3P12035 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT3P12035 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRT3P12035 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT3P12035 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms