Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms