Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRCP08575 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms