Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPBP07199 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPBP07199 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms