Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PRM2P04554 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRM2P04554 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRM2P04554 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRM2P04554 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRM2P04554 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRM2P04554 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PRM2P04554 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms