Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1AO95602 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms