Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SKAP2O75563 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKAP2O75563 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms